Léon Verschueren fonde en 1891 une manufacture d'orgues à Heythuysen. Après la seconde guerre mondiale, l'entreprise est également active à l'étranger. À partir de 1970 environ, une nouvelle expérience est acquise dans la restauration d'orgues historiques. Cette connaissance est importante dans la facture d'orgues neufs sur des modèles historiques, qui distinguent la manufacture également sur le plan international.
Pendant trois générations successives, l'entreprise est conduite par des membres de la famille Verschueren, jusqu'en novembre 2010, quand les actions sont transférées à la fondation Stichting Verschueren Orgelbouw et Johan Zoutendijk est nommé directeur statutaire. En octobre 2015, les ateliers sont transférés de Heythuysen à Ittervoort.
Pour son centième anniversaire, la manufacture d'orgues a reçu le titre de «fournisseur de la Cour», qui fut renouvelé vingt-cinq ans plus tard.